تعداد نشریات | 43 |
تعداد شمارهها | 1,262 |
تعداد مقالات | 15,535 |
تعداد مشاهده مقاله | 51,553,463 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 14,493,596 |
بررسی تبارزایی دو جدایهی ایرانی ویروس موزاییک رگهای گندم (Wheat streak mosaic virus) بر اساس ناحیهی کد کنندهی پروتئیناز NIa-Pro | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 12، دوره 6، شماره 3، آذر 1396، صفحه 151-161 اصل مقاله (851.92 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
عاطفه حسینی* 1؛ خدیجه سالاری2 | ||
1استادیار بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند. | ||
2مربی بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت. | ||
چکیده | ||
چکیده ویروس موزاییک رگهای گندم (WSMV) Wheat streak mosaic virus از ویروسهای خسارت زای غلات مربوط به خانواده Potyviridae و جنس Tritimovirus است. در این تحقیق، NIa-Pro که یکی از مهمترین پروتئینازهای این ویروس میباشد، مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور 116 نمونهی علائمدار گندم از مزارع خراسان شمالی، خراسان جنوبی و آذربایجان غربی جمعآوری و به منظورشناسایی اولیه، کلیهی نمونهها با آزمون الایزا آزمایش گردیدند و تعداد 10 نمونه در مقابل آنتی بادی اختصاصی WSMV واکنش مثبت نشان دادند. این 10 نمونه مثبت در گلخانه روی گیاه گندم تکثیر و با آغازگر اختصاصی مربوط به توالی کامل NIa-Pro در آزمون RT-PCR سنجش شده و قطعهای به طول 732 جفت باز تکثیر گردید. سپس دو جدایه متفاوت از نظر جغرافیایی مربوط به آذربایجان غربی و خراسان شمالی، همسانه سازی و تعیین ترادف شد. در مقایسهی ترادفهای به دست آمده در این تحقیق با ترادف های موجود در ژن بانک، دو گروه تشکیل شد. جدایههای ایرانی مربوط به این مطالعه در گروه یک، زیر گروه IB و مجزا از جدایههای اروپایی و جدایه ایرانی که در تحقیقات پیشین تعیین توالی شده بود و نزدیک به جدایه آمریکایی (NC-001886)، بودند قرار گرفتند. بررسی مکانهای برشی در ژن NIa-Pro نشان داد که مناطق برش، در این پروتئین حفاظت شده است، جایگزینی تعدادی اسید آمینه در مکانهای حفاظت شده نظیر توالیGKSH در محل 124-121، A/T در جایگاه 154و گلوتامین با آلانین در جایگاه 208 در جدایههای ایرانی مشهود بود. تحقیق حاضر اولین بررسی جدایههای ایرانی در ناحیهی کد کننده مذکور میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
واژه های کلیدی: الایزا؛ غلات؛ واکنش زنجیرهای پلیمراز؛ تبارزایی | ||
مراجع | ||
رضایی م، جعفرپور ب، فلاحتی رستگار ب و سبک خیز م. 1388. شناسایی ویروس موزاییک رگهای گندم در استان خراسان شمالی با استفاده از روشهای سرولوژیکی و مولکولی. پنجمین کنگره سراسری ویروس شناسی و اولین کنگره واکسن ایران، موسسه واکسن و سرم سازی رازی ایران، تهران. معصومی م، یاسایی م، زارع آ، افشاریفر ع و ایزدپناه ک. 1385. آنالیز ترادف نوکلئوتیدی ناحیه 3 ژنوم جدایه های ویروس موزاییک رگه ای گندم در ایران. مجله بیماریهای گیاهی0 جلد42. صفحههای 253 تا 255. خدیور ر و نصرا...نژاد س. ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک رگهای گندم در مزارع غلات استان گلستان. 1388. مجله پژوهش های تولید گیاهی، جلد چهارم، شماره شانزدهم، صفحههای 137 تا 147. Adams M, Antoniw J and Beaudoin F, 2005. Overview and analysis of the polyprotein cleavage sites in the family Potyviridae. Molecular Plant Pathology 6 (4): 471–487. Adams M J, Antoniw, J F and Fauquet CM, 2005. Molecular criteria for genus and species discrimination within the family Potyviridae. Archives of Virology 150: 459–479. Allaire M, Chernaia M M, Malcolm, B A and James M N, 1994. Picornaviral 3C cysteine proteinases have a fold similar to chymo trypsin-like serine proteinases. Nature369: 72–76. Chung B Y W, Miller W A, Atkins J F and Firth AE, 2008. An overlapping essential gene in the Potyviridae. PNAS 105 (15) 5897–5902. Clark M F and Adams A N, 1977. Characteristics of microplate method of enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology 34:475-483. Clewley J P and Arnold C, 1996. Sequence Data Analysis Guidebook Series: Methods in Molecular Biology|Volume: 70 Page Range: 119-129. Foulad P, and Izadpanah K, 1986. Identification of wheat streak mosaic virus in Iran. Agricultural Research 5: 73-84. Kapust RB, Tözser J, Copeland TD, and Waugh DS, 2002. The P1′ specificity of tobacco etch virus protease. Biochem. Biophys. Research 294: 949–955. Lu G; Moriyama, 2004. Vector NTI, a balanced all-in-one sequence analysis suite. Briefings in Bioinformatics 5 (4): 378–388.
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 711 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 513 |