تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,323 |
تعداد مقالات | 16,270 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,953,789 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,624,463 |
بررسی فیلوژنتیکی و تکاملی توالی ژن میوستاتین شتر ترکمن در مقایسه با عملکرد این ژن در گونههای دیگر | ||
پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی) | ||
مقاله 5، دوره 29، شماره 4، اسفند 1398، صفحه 69-88 اصل مقاله (1.46 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
کریم نوبری1؛ عباس بهاری2؛ مرتضی بیطرف ثانی3؛ عبداله کاویان1 | ||
1بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی گلستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان | ||
2پژوهشکده فناوریهای نوین زیستی، دانشگاه زنجان | ||
3بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی یزد، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، یزد | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعاتی: حدود 2 هزار نفر از 150 هزار نفر جمعیت شتر ایران در استان گلستان پرورش داده میشوند که هدف عمده نگهداری آنها گوشت و شیر میباشد. میوستاتین یا فاکتور تمایز 8 (GDF8) از خانواده فاکتورهای تمایز رشد بتا (TGF-β)، عامل محدود شدن توده عضلات اسکلتی میباشد، بنابراین جهش در این ژن میتواند باعث نوسانات شدید در تولید گوشت لخم در گونههای دامی گردد. هدف: این تحقیق با هدف بررسی توالی ژن میوستاتین با رویکرد بررسی تعیین روابط تکاملی نوکلئوتیدهای آن و نحوه عمل انتخاب طبیعی بر روی توالی نوکلئوتیدها و در نتیجه توالی اسیدهای آمینه پروتئین میوستاتین شتر ترکمن ایرانی با سایر گونهها صورت گرفته است. روش کار: در این تحقیق برای اولین بار ژنوم کامل یک نفر شتر ترکمن بر اساس توالییابی Hiseq 2000 شرکت ایلومینا انجام گرفت. با استفاده از روش Denovo حدود 235978 موارد کانت شده بدست آمد که با استفاده از خوانش منطقهای، مورد کانت شده مربوط به ژن میوستاتین مشخص گردید. با بررسی همترازی توالی کامل ژن، اگزونها و توالیاسید آمینهای آن درختهای فیلوژنتیک تهیه گردید. نتایج: مقایسه توالی میوستاتین شتر ترکمن ایرانی و سایر گونههای شتر نشان داد که از لحاظ تکاملی این ژن بین شترهای دوکوهانه و تککوهانه عربی قرار میگیرد. تفاوتی بین توالی پروتئین در هیچکدام از شترهای مورد بررسی مشاهده نشد که دلیل آن وجود جهشها در نواحی اینترون ژن و یا مترادف بودن جهشهای اتفاق افتاده، میباشد. نتیجهگیری نهایی: در بررسی ژن میوستاتین، علیرغم اینکه بین توالی نوکلئوتید اینترون و اگزونهای ژن در این خانواده بین 1 تا 104 نوکلئوتید تفاوت وجود دارد، در توالی اسیدهای آمینة پروتئین این ژن تفاوتی مشاهده نگردید که نشاندهنده حفاظت کامل پروتئین این ژن طی دوره تکاملی میباشد. مقایسه شتر ترکمن ایرانی با سایر گونهها نشان داد که گونههای شتر در یک گروه و در نزدیکی گونه اسب، انسان، گوسفند و بز قرار میگیرند. | ||
کلیدواژهها | ||
فاکتور تمایز 8؛ ژنوم شتر ترکمن؛ همترازی؛ توالییابی؛ تکامل | ||
مراجع | ||
Abdel-Aziem EA, El-Kader HAM, Alam SS and Othman OE, 2015. Detection of Msp Ipolymorphism and the single nucleotide polymorphism (SNP) of GHgene in camel breeds reared in Egypt. African Journal of Biotechnology 14: 752-757.
Ahmadpanah J, 2016. Phylogenetic Analysis and Molecular Evolution of the Leptin Gene. Research on Animal Production 7(13): 208-213.
Ansari-Renani H, Salehi M, Ebadi Z and Moradi S, 2010. Identification of hair follicle characteristics and activity of one and two humped camels. Small Ruminant Research. 90: 64-70.
Bish LT, Sleeper MM, Forbes SC, Morine KJ, Reynolds C, Singletary GE, Trafny D, Pham J, Bogan J, Kornegay JN, Vandenborne K, Walter GA and Sweeney HL, 2011. Long-term systemic myostatin inhibition via liver-targeted gene transfer in golden retriever muscular dystrophy. Human Gene Therapy 22: 1499-1509.
Burger PA, 2016. The history of Old World camelids in the lightof molecular genetics. Tropical Animal Health and Production. 48: 905–913.
Busquets S, Toledo M, Orpí M, Massa D, Porta M, Capdevila E, Padilla N, Frailis V, López-Soriano FJ, Han HQ, Argilés JM, 2012. Myostatin blockage using actRIIB antagonism in mice bearing in Lewis lung carcinoma results in the improvement of muscle wasting and physical performance. Journal of Cachexia Sarcopenia and Muscle 3: 37-43.
Chuluunbat B, Charruau P, Silbermayr K, Khorloojav T and Burger PA, 2014. Genetic diversity and population structure of Mongolian domesticBactrian camels (Camelus bactrianus). Animal Genetics 45: 550–558.
Clop A, Marcq F, Takeda H, Pirottin D, Tordoir X, Bibé B, Bouix J, Caiment F, Elsen JM, Eychenne F, Larzul C, Laville E, Meish F, Milenkovic D, Tobin J, Charlier C, Georges M, 2006. A mutation creating a potential illegitimate microRNA target site in the myostatin gene affects muscularity in sheep. Nature Genetics 38: 813–818.
Ghaderi-Zefrehei M, Amiri M, Hashemi L, Samadian F, 2019. Exploring structure, CPG islands, DNA methylation and protein of candidate genes influencing mastitis in dairy cows. journal of Animal Science Researches 29(1): 107-123.
Hedayat-Evrigh N, Vahedi V, Seyed-Sharifi R and Boustan A, 2016. Sequencing and identification of single nucleotide polymorphisms of Partial myostatin gene in dromedary and Bactrian camels. Agricultural Biotechnology Journal 8(3): 120-135.
Kota J, Handy CR, Haidet AM, Montgomery CL, Eagle A, Rodino-Klapac LR, Tucker D, Chilling CJ, Therfall DR, Walker CM, Weisbrode SE, Lanssen PML, Reedclarck R, Sahenk Z, Mendell JR and Kaspar BK, 2009. Follistatin gene delivery enhances muscle growth andstrength in nonhuman primates. Science Translational Medicine 1(66): ra15.
Michu E, 2007. A short guide to phylogeny reconstruction. Pant, Soil and Environmrnt 53(10): 442–446.
Mosher DS, Quignon P, Bustamante CD, Sutter NB, Mellersh CS, Parker HG and Ostrander EA, 2007. A mutation in the myostatin gene increases muscle mass and enhances racing performance in heterozygote dogs. PLoS Genetics 3: e79.
Muzzachi S, Oulmouden A, Cherifi Y, Yahyaoui H, Zayed MA, Burger P, Lacalandra GM, Fayeand B and Ciani E, 2015. Sequence and polymorphism analysis of the camel (Camelus dromedarius) myostatin gene. Emirates Journal of Food and Agriculture 27(4): 367-373.
Ramadan S, Inoue-Murayama M, 2017. Advances in camel genomics and their applications: A review. The Journal of Animal Genetics 45: 49–58.
Sajadi Zarjani S, Bahreini Behzadi MR, Fardaei M, 2016. Sequencing of third exon of IGF1 gene in sheep. Agricultural Biotechnology Journal 7(4): 83-96.
Shah MG, Qureshi AS, Reissmann M and Schwartz HJ, 2006. Sequencing and sequence analysis of Myostatin gene in the exon 1 of the camel (Camelus Dromedarius). Pakistan Veterinary Journal 26(4): 176-178.
Stinckens A, Georges M and Buys N, 2011. Mutations in the myostatin gene leading tohypermuscularity in mammals: indications fora similar mechanism in fish? Animal Genetics 42(3): 229-234.
Tahmoorespur M, Sekhavati MH, Kahbiri AA and Mohammadhashemi A, 2016. Sequencing and Bioinformatics Analysis of Kappa‐Casein Exon 4 Gene in Iranian Bacterianus and Dromedaries Camels. Iranian Journal of Applied Animal Science 6(1): 219-224.
Villanueva B, Pong-Wong R and Wooliams J, 2002. Marker assisted selection with optimised contributions of the candidates to selection. Genetics Selection Evolution 34: 679–703.
Wang Q and Mcpherron A, 2012. Myostatin inhibition inducesmuscle fbre hypertrophy prior to satellite cell activation. The Journal of Physiology 590: 2151-2165.
Welle S, Mehta S and Burgess K, 2011. Effect of postdevelopmental myostatin depletion on myofibrillar protein metabolism. American Journal of Physiology, Endocrinology and Metabolism 300: 993-1001.
Yi L, Ai Y, Ming L, Hai L, He J, Guo FC, Qiao XY, Rimutu Ji, 2017. Molecular diversity and phylogenetic analysis of domestic and wild Bactrian camel populations based on the mitochondrial ATP8 and ATP6 genes. Livestock Science 199: 95-100. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 686 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 401 |