تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,304 |
تعداد مقالات | 15,960 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,310,674 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,069,700 |
ردیابی و بررسی تبارزایی ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus) در گیاه زعفران (Crocus sativus L.) در ایران | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 2، دوره 7، شماره 1، خرداد 1397، صفحه 17-28 اصل مقاله (747.32 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
مریم حیدری1؛ سیده عاطفه حسینی* 2؛ راضیه دری3 | ||
1دانشجوی کارشناسی ارشد بیماریشناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند. | ||
2استادیار بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند. | ||
3کارشناس مرکز تحقیقات زیست محیطی خراسان جنوبی. | ||
چکیده | ||
چکیده ویروس موزائیک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یکی از اعضای جنس پوتیویروس میباشد که وسیعترین دامنهی میزبانی را در بین پوتیویروسها دارد. به منظور ردیابی و شناسایی این ویروس، در ماههای آبان و آذر سال 1395 از مزارع زعفران دارای علائم استان خراسان جنوبی و شهرستان های قاین، خوسف و بیرجند تعداد 175 نمونه برداشت گردید. ردیابی اولیهی ویروس با آزمون الایزا صورت گرفت که طی آن آلودگی نمونهها 85/10 درصد برآورد شد. سپس RNA کل استخراج و در آزمون RT-PCR با آغازگر اختصاصی ژن پروتئینپوششیTuMV ، قطعهای به طول تقریبی 980 جفت باز تکثیر و تعداد 9 جدایه تعیین توالی شد. بررسی تبارزایی 9 جدایهی ایرانی با جدایههای موجود در بانک ژن بر مبنای توالی کامل ژن پروتئین پوششی، نشان داد که شش جدایه در گروه Asian BR همراه با جدایههایی از چین، ترکیه و ایران قرار میگیرند. در صورتیکه سه جدایهی دیگر این تحقیق درکنار سایر جدایههای ایرانی این ویروس، در گروه World B نزدیک به جدایههایی از کانادا و نیوزلند قرار میگیرند. بیشترین شباهت بین جدایه SKK10 از ایران با جدایهی ایرانی IRNTT3 به میزان 96/98 درصد و کمترین بین جدایهی ایرانی SKK10 با AB 093598 از ایتالیا به میزان5/84 درصد میباشد. از آنجا که جدایههای ایرانی این ویروس روی گیاه زعفران در دو گروه کاملا مجزا قرار دارند، بنابراین از اجداد متفاوتی منشا گرفتهاند. تحقیق حاضر اولین بررسی ویروس مذکور روی گیاه زعفران در ایران است. | ||
کلیدواژهها | ||
واژه های کلیدی: ایران؛ ویروس موزائیک شلغم؛ پوتی ویروس؛ زعفران | ||
مراجع | ||
منابع ایزدپناه ک، 1361. لیست مشروح بیماری های ویروسی و شبه ویروسی گیاهان در استان فارس، دانشگاه شیراز. .صفحه 188.. سبک خیز م ع، جعفرپور ب، شهریاری احمدی ف ا. طریقی س و صفرنژاد م ر، 1394. شناسایی ویروس موزاییک شلغم در خردل کاذب از ایران. حفاظت گیاهان، جلد 29. شماره2. صفحههای 231 تا 237. قربانی ش، شهرآئین ن، دهقانیار ح، سهندی ا.و پوررحیم ر، 1386. تشخیص سرولوژیکی و خالص سازی ویروس موزائیک شلغم (TuMV) از گیاه کلزا. .مجله زیست شناسی ایران، جلد 20، صفحههای 61 تا 71. Chang A. 1993. Modified CTAB RNA extraction method. Plant Molecular Biology reporter, 11: 113-116 Clark MF and Adams AN, 1977. Characteristics of microplate method of enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of plant viruses. Journal of General Virology, 34:475-483. Clewley JP and Arnold C, 1996. Sequence Data Analysis Guidebook Series:Methods in Molecular Biology, 70: 119-129. Farzadfar S, Ohshima K, Pourrahim R, Golnaraghi A, Sajedi S and Ahoonmanesh A, 2005. Reservoir weed hosts for Turnip mosaic virus in Iran. Plant Disease, 89: 339. Farzadfar S, Tomitaka Y, Ikematsu M, Golnaraghi AR, Pourrahim R, Ohshima K. 2009. Molecular characterization of Turnip mosaic virus isolates from Brassicaceae weeds. European Journal of Plant Pathology, 124:45–55. Farzadfar SH and Pourrahim R, 2014. Characterization of Turnip mosaic virus from the Asian-BR Population in Iran. Plant Virus Research Department, Iranian Research Institute of Plant Protection (IRIPP), P.O.Box 19395-1454 Tehran, Iran. Journal of Phytopathology. Haj Kassem A, and Walsh J, 2008. Characterising resistance to Turnip mosaic virus (TuMV) in turnip (Brassica rapa rapa). Arabian Journal of Plant Protection, 26: 168-172. Hughes SL, Green SK, Lydiate DJ and Walsh JA, 2002. Resistance to Turnip mosaic virus in Brassica rapa and B. napus and the analysis of genetic inheritance in selected lines. Plant Pathology, 51:567-573. Korkmaz S, Tomitaka Y, Onder S and Ohshima K,2008. Occurrence and molecular characterization of Turkish isolates of Turnip mosaic virus. Plant Pathology,57:1155-1162. Martin D, Murrell B, Golden M, Khoosal A, Muhire B, 2015. RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes. Virus Evolution, 1:5-10. Monci FS, Nchez Campos S, Navas Castillo J and Moriones E, 2002. A natural recombinant between the geminiviruses Tomato yellow leaf curl Sardinia virus and Tomato yellow leaf curl virus exhibits a novel pathogenic phenotype and is becoming prevalent in Spanish populations. Virology, 303: 317–326. Muhire BM, Varsani A and Darren PM, 2014. SDT: A Virus Classification Tool Based on Pairwise Sequence Alignment and Identity Calculation. Plos 1. 9(9) Nguyen HD, Tomitaka Y, Ho S, Duchene S, Vetten HJ, Lesemann D, Walsh JA, Gibbs AJ and Ohshima K, 2013. Turnip mosaic potyvirus probably first spread to Eurasian brassica crops from wild orchids about 1000 years ago. PLoS One, 8 (2): E55336.4. Ohshima K, Yamaguchi Y and Hirota R, 2002. Molecular evolution of Turnip mosaic virus; evidence of host adaptation, genetic recombination and geographical spread. Journal of General Virology, 83:1511–1521. Ohshima K, Tomitaka Y, Wood JT, Minematsu Y, Kajiyama H, Tomimura K and Gibbs A J, 2007. Patterns of recombination in Turnip mosaic virus genomic sequences indicate hotspots of recombination. Journal of General Virology, 88: 298-315. Sanchez F, Wang X, Jenner CE, Walsh JA and Ponz F, 2003. Strains of Turnip mosaic potyvirus as defined by the molecular analysis of the coat protein gene of the virus. Virus Research. 94: 33-43. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A and Kumar S, 2013. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution, 30: 2725-2729. Tan Z, Wada Y, Chen J and Ohshima K, 2004. Inter- and intralineage recombinants are common in natural populations of Turnip mosaic virus. Journal of General Virology,85: 2683–96 Tomimura K, Spak J, Katis N, Jenner CE, Walsh JA and Gibbs AJ, 2004. Comparisons of the genetic structure of populations of Turnip mosaic virus in West and East Eurasia. Virology, 330: 408-423. Tomitaka Y and Ohshima K, 2006. A phylogeographical study of the Turnip mosaic virus population in East Asia reveals an ‘emergent’ lineage in Japan. Molecular Ecology, 15: 4437-4457. Wang RY and Pirone TP, 1999. Purification and characterization of Turnip mosaic virus helper component protein. Phytopathology, 89:564-567. Yasaka R, Ohba K, Schwinghamer M, Fletcher J, Ochoa-Corona F, Thomas J, Ho S,. Gibbs A, and Ohshima K. 2015. Phylodynamic evidence of the migration of turnip mosaic potyvirus from Europe to Australia and New Zealand. Journal of General Virology, 96, 701–713 | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 920 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 761 |