تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,323 |
تعداد مقالات | 16,270 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,954,063 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,624,721 |
مطالعه تنوع ژنتیکی اسبهای عرب و کاسپین با استفاده از مارکرهای ریز ماهواره | ||
پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی) | ||
مقاله 13، دوره 27، شماره 3، آذر 1396، صفحه 175-183 اصل مقاله (851.45 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
حمید بناءآبادی1؛ محمد رضا مشایخی* 1؛ علی حسن پور2؛ محمد رضا ایوبی3 | ||
1گروه ژنتیک، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران | ||
2گروه علوم درمانگاهی دامپزشکی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران | ||
3دکتری تخصصی بیماریهای دامهای بزرگ، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعاتی: امروزه استفاده از مارکسهای ژنتیکی جهت حفظ و مدیریت تنوع در نژادهای مختلف اسب در سراسر جهان بسیار مرسوم است. هدف: در این تحقیق تنوع توالی تکراری کوتاه در نژادهای اسبهای عرب و کاسپین با استفاده از 4 جایگاه VHL20, HTG4, AHT4, HMS7موردتوافق انجمن ژنتیک حیوانات (ISAG) موردبررسی قرار گرفته و فراوانی آللی تعیین شده است. روش کار: برای این منظورDNA ژنومی از نمونه خونی اسبها توسط روش مایلر استخراج گردید. DNA بهوسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز چندگانه توسط پرایمر نشاندار تکثیر شد. محصولات حاصل توسط دستگاه الکتروفورز کاپیلاری مورد آنالیز ژنتیکی قرار گرفت. نتایج: نتایج حاصل از ژنوتایپ، حاکی از وجود متوسط 5/7 آلل در اسبهای عرب و7 آلل در اسبهای کاسپین بود. متوسط هتروزیگوسیته مشاهدهشده Ho)) 761/. در اسب عرب و 799/0 در اسب کاسپین و همچنین متوسط هتروزیگوسیته مورد انتظار (He) 779/0 در اسب عرب و 84/0 در اسب کاسپین بود. نتیجهگیری نهایی: نتایج نشاندهنده چندشکلی و کارآمدی بالای چهار جایگاه مورداستفاده در تعیین نژاد، تنوع و تستهای ابوت میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
تنوع ژنتیکی؛ توالی تکراری کوتاه؛ ریز ماهواره؛ تستهای ابوت؛ مولتی پلکسPCR | ||
مراجع | ||
Amirinia C, Seyedabadi H, Banabazi M. H and Kamali M. A, 2007. Bottleneck Study and Genetic Structure of Iranian Caspian Horse. Pakistan Journal of Biological Sciences 10(9): 1540-1543.
Binns MM, Holmes NG, Rolliman A and Scott AM, 1995. The identification of polymorphicmicrosatellite loci in the horse and their use in thoroughbred parentage testing. British Veterinary Journal 151(1): 9-15.
Bowling AT, 2001. Historical development and application of molecular genetic tests for horse identification and parentage control. Livestock Production Science 72(1): 11-116.
Ellegren H, Johansson M, Sandberg K and Andersson L, 1992. Cloning of highly polymorphic microsatellites in the horse. Animal genetics 23(2): 133-142.
Fornal A, Radko A and Piestrzyńska-Kajtoch A, 2013. Genetic polymorphism of Hucul horse population based on 17 microsatellite loci. Acta Biochimica Polonica 60(4): 761-765.
Georgescu SE, Condac E, Rebedea M, Tesio CD, Dinischiotu A and Costache, M, 2005. Arabian horses genotyping using seventeen microsatellites. Archiva Zootechnica 8:173-178.
Guekin G, Bertaud M and Amigues Y, 1994. Characterization of seven new horse microsatellites: HMS1, HMS2, HMS3, HMS5, HMS6, HMS7 and HMS8. Animal genetics 25(1): 62-62.
Haeringen HV, Bowling AT, Stott ML, Lenstra JA and Zwaagstra KA, 1994. A highly polymorphic horse microsatellite locus: VHL20. Animal genetics 25(3): 207-207.
Khanshour AM, Conant EK, Juras R and Cothran EG, 2013. Microsatellite analysis for parentage testing of the Arabian horse breed from Syria. Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences 37(1): 9-14.
Kimpton C, Fisher D, Watson S, Adams M, Urquhart A, Lygo J and Gill P, 1994. Evaluation of an automated DNA profiling system employing multiplex amplification of four tetrameric STR loci. International journal of legal medicine 106(6): 302-311.
Mahrous KF, Hassanane M, Mordy MA, Shafey HI and Hassan N, 2011. Genetic variations in horse using microsatellite markers. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology 9(2): 103-109.
Micka KA, Sprecher CJ, Lins AM, Comey CT, Koons BW, Crouse C and Ma M, 1996. Validation of multiplex polymorphic STR amplification sets developed for personal identification applications. Journal of Forensic Science 41(4): 582-590.
Miller SA, Dykes DD and Polesky HF, 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic acids research 16(3): 1215.
Mostafa F, Mohammad JK, Abbas D and Saadat M, 2011. Identity testing with fourteen genetic markers of Arabian horses in Charmahal-va-Bakhtiari province. International Conference on Life Science and Technology 3: 202-204.
Schlötterer C, 2000. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. Chromosoma 109(6): 365-371.
Shahsavarani H and Rahimi-Mianji G, 2010. Analysis of genetic diversity and estimation of inbreeding coefficient within Caspian horse population using microsatellite markers. African Journal of Biotechnology 9(3): 293-299.
Weinstock J, Willerslev E, Sher A, Tong W, Ho SY, Rubenstein D and Prieto A, 2005. Evolution, systematics, and phylogeography of Pleistocene horses in the New World: a molecular perspective. PLoS Biology 3(8): e241.
Wimmers K, Ponsuksili S, Schmoll F, Hardge T, Hatzipanagiotou A, Weber J and Schellander K, 1998. Efficiency of microsatellite markers of the international standard panel for parentage control in German horse populations. Zuechtungskunde (Germany) 7:233-241.
Winton CL, Plante Y, Hind P, McMahon R, Hegarty MJ, McEwan NR and Nash DM, 2015. Comparative genetic diversity in a sample of pony breeds from the UK and North America: a case study in the conservation of global genetic resources. Ecology and Evolution 5(16): 3507-3522. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,163 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 587 |