تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,303 |
تعداد مقالات | 16,020 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,486,242 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,213,436 |
تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی دو جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و بررسی جایگاه فیلوژنتیکی آنها | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 3، دوره 6، شماره 1، فروردین 1396، صفحه 27-40 اصل مقاله (881.78 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
حسین معصومی* 1؛ فاطمه محمدی پاقلعه2؛ خدیجه سالاری3؛ جهانگیر حیدرنژاد4؛ اکبر حسینی پور4 | ||
1استاد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر. | ||
2دانشجوی سابق کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان. | ||
3مربی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت. | ||
4دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان. | ||
چکیده | ||
چکیده ویروس موزاییک هندوانه (WMV) Watermelon mosaic virusمتعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae از ویروسهای مهم آلوده کننده کدوئیان در دنیا محسوب میشود. دو جدایه این ویروس به نامهای YAZ.WMV.41 و YAZ.WMV.55 از مزارع خیار و طالبی استان یزد جمعآوری گردید. آلودگی نمونهها با آزمون سرولوژیکی الایزای مستقیم و غیرمستقیم و آنتی بادی پلیکلونال این ویروس بررسی شد. این دو جدایه در مقابل آنتیبادی واکنش نشان ندادند. در بررسی علائم این جدایهها برروی گیاهان آزمون کدوی مراغه، لوبیا چیتی و لوبیا چشم بلبلی، علائم متفاوتی با آنچه تا کنون در مورد جدایههای این ویروس گزارش شده، مشاهده گردید. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی قطعهای به طول 809 جفت باز از ژن پروتئین پوششی تکثیر و تعیین ترادف شد. مقایسهی ترادفهای بدست آمده در این تحقیق با ترادفهای موجود در بانک جهانی ژن نشان داد که جدایههای مورد مطالعه به همراه یک جدایهی ایرانی (رس شمار EU667627) با دامنهی میزبانی متفاوت، در زیر گروه IIB قرار میگیرند. سایر جدایههای ایرانی گزارش شده قبلی در گروههای I و AII قرار گرفتند. مقایسهی میزان تشابه اسید نوکلئیک این جدایهها با یکدیگر نشان داد که جدایههای ایرانی مربوط به این مطالعه بیشترین و کمترین میزان شباهت را با جدایههای کشورهای اسپانیا (رس شمار AJ579518) و ایران (رس شمار GQ421161) به ترتیب به میزان 5/99 و 2/92 درصد دارا میباشند. نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر این است که کدوئیاندر مزارع وگلخانههای ایران بوسیله جدایههای متعدد این ویروس آلوده می شوند. | ||
کلیدواژهها | ||
الایزا؛ کدوئیان؛ واکنش زنجیرهای پلیمراز؛ ویروس موزائیک هندوانه | ||
سایر فایل های مرتبط با مقاله
|
||
مراجع | ||
سمیعی ا، 1383. شناسائی، تعیین پراکنش و بررسی برخی خصوصیات ویروسهای آلوده کننده کدوئیان در گلخانههای ایران. پایان نامه کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید باهنر کرمان. ابراهیم نسبت ف، 1351. گزارشی درباره جدا کردن ویروس موزائیک هندوانه در ایران. مجله بیماریهای گیاهی. جلد هشتم، صفحههای 17تا20. Abou-Jawadah Y, Sobh H, EL-Zammar S, Fayyad A, and Lecoq H, 2000. Incidence and management of virus disease of Cucurbits in Lebanon. Crop Protection 19: 217-224 . Clark MF and Adams SA N, 1977. Characteristics of microplates method of enzyme-linked-immunosorbent assay for detection of plant viruses. Journal of General Virology 34: 475-483. Hall TA, 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95-98. Lecoq H, Desbiez C and Delecolle B, 2008. Cytological and molecular evidence that the whitefly-transmitted Watermelon mosaic virus and Papaya ring spot virus is a tentative member of the family Potyviridae. Journal of General Virology 81: 2289-2293. Massumi H, Samei A, Hosseini-Pour A, Shabanian M and Rahimian H, 2007. Occurrence, distribution and relative incidence of seven virus infecting greenhouse- grown cucurbits in Iran. Plant Disease 91: 159-163. Moreno IM, Malpica JM, Diaz-Pendon JA, Moriones E, Fraile A and Garcia-Arenal F, 2004.Variability and genomic structure of the population of Watermelon mosaic virus infecting melon in Spain. Virology 318: 451-460. Muhire BM, Varsani A and Martin DP, 2014. SDT: A Virus Classification Tool Based on Pairwise Sequence Alignment and Identity Calculation’,PLoS One, 9: e108277. Nagel H and Hiebert F, 1985. Structure of Watermelon mosaic virus 1. Virology 68: 1006. Purcifull DE, Heibert E and Edwarson J,1984. Watermelon mosaic virus-2. Description of Plant Virus 63: 1-11. Rahimian H and Izadpanah K, 1987. Identity and prevalence of mosaic inducing cucurbit viruses in Shiraz, Iran. Journal of Phytopathologische Zeitschrift 92: 305-312. Rozas J, Snchez-DelBarrio JC, Messeguer X and Rozas R, 2003. DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods. Bioinformatics.19: 2496-2497. Shoeibi S, Masumi M, Nasrollahnezhad S, Heydari S, Izadpanah K and Ahmadikhah A, 2009. Sequencing of six Iranian isolates of Watermelon mosaic virus and phylogenetic comparison of Iranian isolates with other isolates of the world. Journal of Plant Pathology 45: 34-37. Sharifi M, Massumi H, Heydarnejad J, Hosseinipour A, Shabanian M and Rahimian H, 2008. Analysis of the biological and molecular variability of Watermelon mosaic virus isolates from Iran. Virus Genes 37: 317-330. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M and Kumar S, 2011. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 28: 2731-2739. Van Regenmortel MH, 1960. Zone electrophoresis and electron microscopy of a Watermelon mosaic virus from South Africa. Virology 12: 27-130. Zhang JX and Yangfeng WU, 2009. Complete nucleotide sequence of Watermelon mosaic virus China isolate. Virology 13: 42-50. Zitter TA, Hopkins DL and Thomas C E, 1996. Compendium of cucurbit disease. APS Press, New York, 87pp. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 957 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 714 |