تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,303 |
تعداد مقالات | 16,020 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,490,115 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,217,560 |
تشخیص مولکولی گونه ی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 14، دوره 5، شماره 2، مهر 1395، صفحه 175-186 اصل مقاله (787.59 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
مهدی ارزنلو* 1؛ سعید قاسمی اسفهلان2؛ سیما خدایی3؛ مجید توکلی4؛ اسداله بابای اهری5 | ||
1دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
2استاد، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
3دانشجوی دکتری، رشته بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
4دانشجوی دکتری، رشته حشره شناسی کشاورزی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
5استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
چکیده | ||
چکیده گونهی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، به عنوان یکی از عوامل اصلی دخیل در زوال بلوط در ایران معرفی شده است. با این حال اطلاعاتی در مورد پراکنش، دامنهی میزبانی، روشهای انتشار و انتقال عامل بیماری در مناطق آلوده و همچنین احتمال شیوع بیماری در سایر مناطق جنگلی ایران در دسترس نمیباشد. تحقیق حاضربا هدف توسعهی یک روش مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیرهای پلیمرازی جهت تشخیص گونهی B. mediterranea براساس آغازگرهای اختصاصی گونه، اجرا گردید. بدین منظور نمونهبرداری از درختان بلوط با علایم بیماری ذغالی در استان ایلام صورت گرفت. عامل بیماری با استفاده از تکنیکهای متعارف در بیماریشناسی گیاهی جداسازی و خالص سازی گردید. جدایههای Biscogniauxia براساس ویژگیهای ریختشناختی مرحلهی جنسی و توالی یابی ناحیه ITS-rDNAگونهی B. mediterranea شناسایی گردیدند. دادههای توالی ناحیهی ITS-rDNA برای کلیهی گونههای Biscogniauxia موجود در بانک ژن دریافت و همراه با توالیهای ایجاد شده در این تحقیق زیر هم چینی و یک جفت آغازگر اختصاصی (BmF/BmR) با طول قطعهی مورد انتظار400 جفت باز، برای تشخیص مولکولی B. mediterranea طراحی گردید. کارایی جفت آغازگر طراحی شده با استفاده از DNA جدایههای B. mediterranea و دیگر گروههای قارچی جداسازی شده از بافتهای درختان بلوط طی واکنش زنجیرهای پلیمرازی ارزیابی گردید. نتایج حاصل از بررسی محصول واکنش روی ژل آگارز نشان داد که قطعه 400 جفت بازی فقط از جدایههای گونهی B. mediterranea تکثیر میشود. آغازگرهای اختصاصی طراحی شده در این تحقیق در برنامههای مربوط به ردیابی عامل بیماری، مطالعهی پراکنش، دامنهی میزبانی و روشهای انتشار عامل بیماری قابل استفاده خواهند بود. | ||
کلیدواژهها | ||
واژه های کلیدی: اندوفیت؛ بیماری نوظهور؛ زوال بلوط؛ زایلاریاسه | ||
مراجع | ||
Anselmi N, Mazzaglia A and Vannini A, 2000. The role of endophytes in oak decline. pp: 131-144. In Ragazzi A and Dellavalle I (eds.), Decline of oak species in Italy, Accademia Italiana de Scienze Forestali, Firenze. Arzanlou M, Abeln ECA, Kema GHJ, Waalwijk C, Carlier J, Vries I de, Guzmán M and Crous PW, 2007. Molecular diagnostics for the Sigatoka disease complex of banana. Phytopathology 97: 1112-1118. Arzanlou M and Narmani A, 2014. Multiplex PCR for specific identification and determination of mating type in Togninia minima (anamorph Phaeoacremonium aleophilum), a causal agent of esca disease of grapevine. Phytopathologia Mediterranea 53: 240-249. Bakhshi M, Arzanlou M and Babai-Ahari A, 2011. Uneven distribution of mating type alleles in Iranian populations of Cercospora beticola, the causal agent of Cercospora leaf spot disease of sugar beet. Phytopathologia Mediterranea 50: 101-109. Callan BE and RogersJD, 1986. Cultural characters and anamorphs of Biscogniauxia (= Nummularia) marginata, B. dennisii, and B. repanda. Canadian Journal of Botany 64: 842-847. Hsieh H-M, Ju Y-M and Rogers JD, 2005. Molecular phylogeny of Hypoxylon and closely related genera. Mycologia 97: 844-865. Jurc D and Ogris N. 2005. First reported outbreak of charcoal disease caused by Biscogniauxia mediterranea on Turkey oak in Slovenia. New Disease Reports 11: 42. Lievens B and Thomma BPHJ, 2005. Recent developments in pathogen detection arrays: implications for fungal plant pathogens and use in practice. Phytopathology 95: 1374-1380. Luchi N, Capretti P, Pinzani P, Orlando C and Pazzagli M. 2005. Real-time PCR detection of Biscogniauxia mediterranea in symptomless oak tissue. Letters in Applied Microbiology 41: 61-68. Luchi N, Capretti P, Vettraino AM, Vannini A, Pinzani P and Pazzagli M. 2006. Early detection of Biscogniauxia nummularia in symptomless European beech (Fagus sylvatica L.) by TaqManTM quantitative real-time PCR. Letters in Applied Microbiology 2006: 43:33-38. Mazzaglia A, Anselmi N, Gasbarri A and Vannini A, 2001. Development of a Polymerase Chain Reaction (PCR) assay for the specific detection of Biscogniauxia mediterranea living as an endophyte in oak tissues. Mycolgical Research 105 : 952-956. Maxwell A, Jackson SL, Dell B and Hardy GESJ, 2005. PCR-identification of Mycosphaerella species associated with leaf diseases of Eucalyptus. Mycological Research 109: 992-1004. Mirabolfathi M, 2013. Outbreak of charchoal diseaseon Quercus spp and Zelkova carpinifolia trees in forests of Zagros and Alborz mountains in Iran. Iranian Plant Pathotology, 49: 77-79. Mirabolfathi M, Groenewald JZ and Crous PW, 2011. The occurrence of charcoal disease caused by Biscogniauxia mediterranea on Chestnut leaved oak (Quercus castaneifolia) in the Golestan forests of Iran. Plant Diseases, 95: 876. Raei S, Khodaparast SA and Abbasi M, 2014. More records of xylariaceous fungi from North of Iran. Rostaniha, 15(2): 110-121.Moller EM, Bahnweg G and Geiger HH, 1992. A simple and efficient protocol for isolation of high molecular weight DNA from filamentous fungi, fruit bodies, and infected plant tissues. Nucleic Acids Research, 20: 6115–6116. Ragazzi A, Ginetti B and Moricca S, 2012. First report of Biscogniauxia mediterranea on English Ash in Italy. Plant Disease 96: 1694. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A and Kumar S, 2013. MEGA 6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution 30: 2725-2729. Vannini A and Scarascia Mugnozza G, 1991. Water stress : a predisposing factor in the athogenesis of Hypoxylon mediterraneum on Quercus cerris .European Journal of Forest Pathology 21: 193-202. Vannini A and Valentini R, 1994. Influence of water relations in Quercus cerris- Hypoxylon mediterraneum interaction : a model of drought induced susceptibility to a weakness parasite. Tree Physiology 14: 129-139. White T J, Bruns T, Lee S and Taylor J, 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. Pp. 315–322 In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ (eds.), PCR Protocols : A guide to Methods and Applications Academic Press, New York, USA. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,352 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,093 |