تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,300 |
تعداد مقالات | 15,900 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,145,100 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 14,911,662 |
شناسایی مولکولی فیتوپلاسمای همراه جاروک سنجد از برخی مناطق استان آذربایجان شرقی | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 10، دوره 5، شماره 1، فروردین 1395، صفحه 127-141 اصل مقاله (748.63 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
اباصلت حاجی زاده1؛ رضا خاکور* 2؛ نعمت سخندان بشیر3؛ بهرام باغبان4 | ||
1دانشجوی سابق کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی دانشگاه تبریز. | ||
2استادیار گروه گیاهپزشکی دانشگاه تبریز. | ||
3دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشگاه تبریز. | ||
4دانشیار گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه تبریز. | ||
چکیده | ||
چکیده در بازدیدهای سالهای 1391 و 1392 علایم مشابه بیماریهای فیتوپلاسمایی از قبیل زرد شدن برگها، ریزبرگی، کاهش فاصله میانگرهها و جاروک در تعدادی از درختان سنجد در استان آذربایجانشرقی مشاهده شد. در همین راستا، پس از نمونهبرداری، از رگبرگ درختان سنجد مشکوک به آلودگی با فیتوپلاسما و از درختان بدون علایم به طور جداگانه DNA کل استخراج گردید. نمونههای DNA از نظر آلودگی به فیتوپلاسما با آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) مستقیم و آزمون PCRدو مرحلهای (Nested-PCR) مورد بررسی قرار گرفتند و قطعات مورد انتظار به ترتیب با اندازههای تقریبی 1600 و 1200جفت باز از 14 نمونه دارای علایم بیماری تکثیر شد در حالی که قطعهای از نمونههای سالم درPCR تکثیر نیافت. به منظور تعیین جایگاه فیلوژنتیکی، محصول PCR یکی از نمونههای مثبت تعیین ترادف شد. جستجو در بانک جهانی ژن و آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که ترادف به دست آمده با فیتوپلاسماهای گروه زردی مینا (16SrI) طبقهبندی میشود. بر اساس علائم بیماری، تکثیر قطعهی مورد انتظار در آزمون PCR و آنالیز فیلوژنتیکی، بیماری جاروک سنجد در استان آذربایجان شرقی ماهیت فیتوپلاسمایی دارد و فیتوپلاسمای همراه متعلق به گروه RNA ریبوزومی 16SrI می باشد. این اولین گزارش از وجود بیماری جاروک سنجد از استان آذربایجانشرقی میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
واژه های کلیدی: جاروک؛ زردی مینا؛ سنجد؛ فیتوپلاسما | ||
مراجع | ||
پورعلی ح و صالحی م، 1391. تنوع ژنتیکی جدایههای فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک بادام در استانهای فارس، کرمان کردستان. بیماریهای گیاهی، جلد 48، صفحههای 353 تا 366. رئوفی د و صالحی م، 1391. تعیین برخی از ویژگیهای فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک یونجه در استان بوشهر. بیماریهای گیاهی، جلد 48، صفحههای 423 تا 431. سخندان ن، 1383. ویروسهای گیاهی؛ عوامل بیماریزا بی همتا و گمراه کننده. ترجمه. دانشگاه تبریز. 679 صفحه. عباسیان م و صالحی م، 1389. واکنش ارقام هسته دارها به فیتوپلاسمای عامل جاروک بادام. بیماریهای گیاهی، جلد 46، صفحههای 153 تا 160. Al-Saady NA, Khan AM and Bertaccini A, 2008. Candidatus phytoplasma omanense, associated with witches-broom of cassia italica (Mill.) sprenge in Oman. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58:461-466. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW and Lipman DJ, 1990. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology 215:403-410. Green MR and Sambrook J, 2012. Molecular Cloning: a Llaboratory Manual.4th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Gundersen DE and Lee IM, 1996. Ultrasensitive detection of phytoplasmas by nested PCR assays using two universal primer pairs. Phytopathologia Mediterranea 35: 144–151. Gundersen DE, Lee IM, Rehner SA, Davis RE and Kingsbury DT, 1994. Phylogeny of mycoplasma-like organisms (phytoplasmas): a basis for their classification. Journal Bacteriology 176:5244–5254. Heinrich M, Botti S, Caprapa L, Arthfer W, Strommer S, Hanzer V, Katinger H, Bertaccini A and Laimer M, 2001. Improved detection methods for fruit tree phytoplasmas. Plant Molecular Biology Reporter 19:169- 179. Lee IM, Davis RE and Gundersen DE, 2000. Phytoplasma: phytopathogenic mollicutes. Annual Review Microbiology 54:221-255. Lee IM, Gundersen-Rindal DE and Bertaccini A, 1998. Phytoplasma: ecology and genomic diversity. Phytopathology 88:1359-1366. Rashidi M, Chosta Y and Bahar M, 2010. Molecular identification of a phytoplasma associated with Russian olive witches broom in Iran. Plant Pathology 127:157-159. Seemuller E, Schneider B, Maurer R, Ahrens U, Daire X, Kison H, Lorenz KH, Firrao G, Avinent L, Sears BB and Stackebrandt E, 1994. Phylogenetic classification of phytopathogenic mollicutes by sequence analysis of 16S ribosomal DNA. International Journal of Systematic Bacteriology 44:440-446. Schneider B, Ahrens U, Kirkpatrick BC and Seemüller E, 1993. Classification of plant-pathogenic mycoplasma-like organisms using restriction-site analysis of PCR- amplified 16S rDNA. Journal of General Microbiology 139:519-527. Smart CD, Schneider B, Blomquist CL, Guerra LJ, Harrison NA, Ahrens U, Lorenz KH, Seemuller E and Kirkpatrick BC, 1996. Phytoplasma-specific PCR primers based on sequences of the 16S-23S rRNA spacer region. Applied Environmental Microbiology 62:2988-2993. Verdin E, Salar P, Danet JL, Choueiri E, Jreijiri F, Elzammar SL, Gelie B, Bove JM and Garnier M, 2003. 'Candidatus Phytoplasma phoenicium', a new phytoplasma associated with an emerging lethal disease of almond trees in Lebanon and Iran. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53:833-838. Zhang Y, Uyemoto Jk and Kirkpatrick BC, 1998. A small-scale procedure for extracting nucleic acids from woody plants infected with various phytopathogens for PCR assay. Journal Virological Methods 71:45-50.
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,291 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 896 |