
تعداد نشریات | 45 |
تعداد شمارهها | 1,357 |
تعداد مقالات | 16,591 |
تعداد مشاهده مقاله | 53,843,081 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,401,876 |
تنوع ژنتیکی گوسفند نژاد بهمئی با استفاده از نشانگر ریزماهواره | ||
پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی) | ||
دوره 34، شماره 4، اسفند 1403، صفحه 27-39 اصل مقاله (554.09 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/as.2024.60520.1730 | ||
نویسندگان | ||
مصطفی محقق دولت آبادی* ؛ الهه فهیمی؛ جواد حبیبی زاد | ||
گروه علوم دامی، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج | ||
چکیده | ||
تنوع ژنتیکی در صفات اقتصادی، اساس برنامههای اصلاحی در گوسفند است و نبود تنوع در جمعیتهای پایه باعث محدودیت قدرت انتخاب برای رفع نیازهای غیر قابل پیش بینی در آینده است. ریزماهوارهها به عنوان نشانگرهای همبارز و دارای چند شکلی بالا، به سرعت به عنوان بهترین نشانگرهای مولکولی جهت برآورد تنوع ژنتیکی در گونه های متفاوت دامهای اهلی شدهاند. در این مطالعه نیز، تنوع ژنتیکی گوسفند بهمئی استان کهگیلویه و بویراحمد با استفاده از10جایگاه ریزماهواره مورد بررسی قرار گرفت. سپس مقادیر تنوع آللی، شاخص محتوای اطلاعات چندشکلی(PIC)، هتروزیگوسیتی مورد انتظار، هتروزیگوسیتی مشاهده شده، شاخص شانون و تعادل هاردی واینبرگ محاسبه شد. در مجموع 108 آلل در 10 جایگاه مورد بررسی شناسایی شد که بیشترین تعداد آلل متعلق به جایگاه BM6444 و کمترین تعداد آلل مربوط به جایگاه ETH10 بود. همچنین، میانگین تعداد آلل برای کل جایگاهها برابر 8/10 بود. دامنه تعداد آلل موثر برای ریزماهوارهها در محدوده 21/2 الی27/11 با میانگینی برابر 51/6 بود. متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده در همه جایگاهها بیشتر از هتروزیگوسیتی مورد انتظار بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) ریزماهوارهها 79/0 بود و ریزماهواره های ILSTS011 و ETH10 به ترتیب دارای حداکثر و حداقل محتوای اطلاعات چند شکلی بودند. ریزماهواره ETH10 علاوه بر داشتن کمترین تعداد آلل، محتوای اطلاعات چند شکلی حداقل (44/0) را در بین جایگاه ها آشکار ساخت. بیشترین مقدار شاخص شانون مربوط به جایگاه BM6444 با بیشترین تعداد آلل و کمترین مقدار نیز از آن جایگاه ETH10 با کمترین تعداد آلل بود. همچنین میانگین شاخص شانون نیز در جمعیت مورد مطالعه بالا بود (98/1). آزمون مربع کای به منظور بررسی تعادل هاردی واینبرگ برای تمام جایگاهها در سطح جمعیت انجام شد و نتایج حاصل در تمامی جایگاهها انحراف بسیار معنیداری را از تعادل نشان دادند (001/0P<). بطور کلی، نتایج پارامترهای تنوع برآورد شده بیانگر تنوع بالای جمعیت گوسفند بهمئی مورد مطالعه میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
تنوع ژنتیکی؛ ریزماهواره؛ گوسفند بهمئی | ||
مراجع | ||
سلیمانی ب، چهارآیین ب و رحیمی میانجی ق، 1391. بررسی چند شکلی نشانگرهای ریزماهواره ایBM6444، INRA135 و oarhh35 مرتبط با ژن اینهیبین در گوسفند سنجابی. پژوهشهای علوم دامی ایران، جلد4 شماره1، صفحه های 90-84.
سید شریفی ب, هدایت ایوریق ن, سیف دواتی ج , ساور س، 1399. بررسی ساختار ژنتیکی گوسفند سنجابی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره. فصلنامه علمی فیزیولوژی و تکوین جانوری، جلد 13 شماره 4، صفحه های 70-61.
صالحی ز و محقق دولت آبادی م، 1395. تنوع ژنتیکی گوسفند نژاد لک قشقایی در استان کهگیلویه و بویراحمد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره. نشریه پژوهش در نشخوار کنندگان، جلد4 شماره3، صفحه های 6-1.
کسرایی ک، رافت س، شجاع غیاث ج و جوانمرد آ، 1395. آزمون انساب در جمعیت گوسفندهای آمیخته به کمک نشانگرهای ریزماهواره. پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی)، جلد24 شماره 2، صفحه های 150-141.
غلامی ح، 1394 . راهنمای پرورش گوسفند و بز ویژه طرح بسیج همگام با کشاورز./گوسفند بهمئی https://sabokdam.com/
نقویان س، حسنی س، آهنی آذری م، خان احمدی ع، ساقی دع، مامیزاده ن، 1393 مطالعه تنوع ژنتیکی گوسفند کردی شیروان با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره و مقایسه ضریب همخونی بدست آمده با استفاده از اطلاعات شجرهای. پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی)، جلد 24 شماره 1، صفحه های 105-93.
Ahmed Z, Babar ME, Hussain T, Nadeem A, Awan FI, Wajid A, Shah, SA and Ali MM, 2014. Genetic diversity analysis of Kail sheep by using microsatellite markers. The Journal of Animal and Plant Sciences 24(5): 1329-1333.
Al-Barzinji YMS, Lababidi S, Rischkowsky B, Al-Rawi AA, Tibbo M, Hassen H and Baum M, 2011. Assessing genetic diversity of Hamdani sheep breed in Kurdistan region of Iraq using microsatellite markers. African Journal of Biotechnology 10: 15109- 15116.
Alberto FJ, Boyer F, Orozco-terWengel P, Streeter I, Servin B, de Villemereuil P, Benjelloun B, Librado P, Biscarini F, Colli L and Barbato M, 2018.Convergent genomic signatures of domestication in sheep and goats. Nature Communications 9:813.
Arranz JJ, Bayon Y and Primitivo FS, 2001. Genetic variation at microsatellite loci in Spanish sheep. Small Ruminant Research 39:3-10.
Babar ME, Hussain T, Nadeem N, Jabeen R and Javed M, 2009. Genetic Characterization of Azakheli Buffalo Breed of Pakistan Using Microsatellites DNA Markers. Pakistan Journal of Zoology 9: 361-366.
Barker JFS, 2001. Conservation and management of genetic diversity: a domestic animal perspective. Canadian Journal of Forest Research 31(4):588–595.
Baumung R, Simianer H and Hoffmann I, 2004. Genetic diversity studies in farmanimals—a survey. Journal of Animal Breeding and Genetics 121: 361-373.
Beketov SV, Deniskova TE, Dotsev AV, Nikolaeva EA, Zinovieva NA, Selionova MI and Stolpovsky YA, 2024. Populations of Tuvan Shot Fat-Tailed Sheep in the Gene Pool Structure of the Sheep Breeds of the Russian Federation. Russian Journal of Genetics 60(1):87-99.
Botstein R, White L, Skolnik M and Davis RW, 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. The American Journal of Human Genetics 32: 314-331.
Chen RJ, Yang ZP, Ji DJ, Qu DY, Li YL, Mao YJ and Huang DL, 2009. Analysis of genetic polymorphism in six meat sheep breeds and genetic distances between them. Czech Journal of Animal Science 54:461-467.
Demirci S, Koban Baştanlar E, Dağtaş ND, Pişkin E, Engin A, Özer F, Yüncü, E, Doğan, ŞA and Togan, I, 2013. Mitochondrial DNA diversity of modern, ancient and wild sheep (Ovis gmelinii anatolica) from Turkey: new insights on the evolutionary history of sheep. PLoS One 8:e81952.
Dossybayev K, Orazymbetova Z, Mussayeva A, Saitou N, Zhapbasov R, Makhatov B and Bekmanov B, 2019. Genetic diversity of different breeds of Kazakh sheep using microsatellite analysis. Archives Animal Breeding 62(1):305-12.
Frankham R, Briscoe DA and Ballou JD, 2002. Introduction to Conservation Genetics, Cambridge University Press.
Fuks D and Marom N. 2021. Sheep and wheat domestication in southwest Asia: a meta-trajectory of intensifcation and loss. Animal Frontier: 11:20–9.
Gandini GC and Villa E, 2003. Analysis of the cultural value of local livestock breeds: A methodology. Journal of Animal Breeding and Genetics 120(1): 1–11.
Groeneveld, LF, Lenstra JA, Eding H, Toro MA, Scherf B, Pilling D, Negrini R, Finlay EK, Jianlin H, Groeneveld E and Weigend S, 2010. Genetic diversity in farm animals–a review. Animal Genetics, 41: 6-31.
Hedrick PW, 1995. Gene flow and genetic restoration: The Florida panther as a case study. Conservation Biology 9: 996-1007.
Jawasreh, KI, Ababneh MM, Ismail ZB, Younes AMEB and Al Sukhni I, 2018. Genetic diversity and population structure of local and exotic sheep breeds in Jordan using microsatellites markers. Veterinary World 11(6): 778.
Jyotsana B, Jakhesara S, Prakash V, Rank DN and Vataliya PH, 2010. Genetic features of Patanwadi, Marwari and Dumba sheep breeds (India) inferred by microsatellite markers. Small Ruminant Research 93(1): 57-60.
Kabasakal A, 2023. Intra-Breed Genetic Diversity and Genetic Bottleneck Tests in a Karacabey Merino Sheep Breeding Farm Using Microsatellite Markers. KAFKAS Kafkas Universitesi Veteriner Fakultesi Dergisi, 29(3).
Khan MA, Husain SS, Alam MR, Teneva A, Han JL and Faruque MO, 2009. Genetic relationship in different sheep populations of Bangladesh based on microsatellite markers. Journal of Bangladesh Agricultural University 7: 291-294
Li MH, Zhao SH, Bian C, Wang HS, Wei H, Liu B, Yu M, Fan B, Chen SL, Zhu MJ and Li SJ, 2002. Genetic relationships among twelve Chinese indigenous goat populations based on microsatellite analysis. Genetics Selection Evolution 34:1-6.
Loukovitis D, Siasiou A, Mitsopoulos I, Lymberopoulos AG, Laga V and Chatziplis D, 2016. Genetic diversity of Greek sheep breeds and transhumant populations utilizing microsatellite markers. Small Ruminant Research 136:238-42.
Loukovitis D, Szabó M, Chatziplis D, Monori I and Kusza S, 2023. Genetic diversity and substructuring of the Hungarian merino sheep breed using microsatellite markers. Animal Biotechnology 34(4):1701-1709.
Mahmoudi B, 2010. Genetic Diversity of Lori Goat Population Based on Microsatrllite Marker. Asian Journal of Animal Science 4: 13-19.
Marković M, Radonjić D, Zorc M, Đokić M and Marković B, 2022. Genetic Diversity of Montenegrin Local Sheep Breeds Based on Microsatellite Markers. Animals 12(21): 3029.
Meuwissen TH, 1991. Reduction of selection differentials in finite populations with a nested full-half sib family structure. Biometrics 47(1): 195-203.
Mihailova Y, Rusanov K, Rusanova M, Vassileva P, Atanassov I, Nikolov V and Todorovska EG, 2023. Genetic Diversity and Population Structure of Bulgarian Autochthonous Sheep Breeds Revealed by Microsatellite Analysis. Animals 13(11):1878.
Miller JM, Malenfant RM, David P, Davis CS, Poissant J, Hogg JT, Festa-Bianchet M and Coltman D, 2014. Estimating genome-wide heterozygosity: effects of demographic history and marker type. Heredity 112(3):240-7.
Nanekarani SH, Amirinia C and Amirmozafari N, 2011. Genetic analyses of Karakul sheep breed using microsatellite markers. African Journal of Microbiology 5: 703- 707.
Ocampo R, Cardona H and Martínez R, 2016. Genetic diversity of Colombian sheep by microsatellite markers. Chilean Journal of Agricultural Research 76(1):40-7.
Odjakova T, Todorov P, Kalaydzhiev G, Salkova D, Dundarova H, Radoslavov G, Hristov P, 2023. A study on the genetic diversity and subpopulation structure of three Bulgarian mountainous sheep breeds, based on genotyping of microsatellite markers. Small Ruminant Research 226:107034.
Sharifi–Sidani E, Amirinia C, Lavaf A, Farasati C and Aminafshar A, 2009. Genetic variation among different ecotypes of the Iranian Sanjabi sheep. Journal of Animal Veterinary Advances 8: 1173- 1176.
Thimmappaiah W, Santhosh G, Shobha D and Melwyn GS, 2008. Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Sciatica Horticulture 118: 1-7.
Van der Westhuizen L, Magwaba T, Grobler JP, Bindeman H, du Plessis C, Van Marle-Köster E and Neser FWC, 2019. Genetic variability in a population of Letelle sheep in South Africa. South African Journal of Animal Science 49(2): 281-289.
Visser C, Marle-Köster EV and Friedrich H, 2011. Parentage verification of South African Angora goats, using microsatellite markers. South African Journal of Animal Science 41: 250- 255.
Yousif AN, Abdullah SM, Shaker AS, Ameen QA, Mohammed MS, Muhammad SJ, Mustafa SM and Aziz CR, 2023. Genetic diversity assessment of some Iraqi Sheep breeds using micro satellite DNA markers. Tikrit Journal for Agricultural Sciences 23(3):41-50. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 108 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 23 |