تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,303 |
تعداد مقالات | 16,020 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,486,997 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,213,966 |
ارزیابی افت ناشی از همخونی در صفات رشد و تولید تخممرغ جمعیت پرندگان ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی خراسان رضوی | ||
پژوهش های علوم دامی (دانش کشاورزی) | ||
دوره 33، شماره 2، شهریور 1402، صفحه 79-92 اصل مقاله (453.66 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/as.2022.49548.1644 | ||
نویسندگان | ||
صابر جلوخانی نیارکی1؛ شعله قربانی* 2؛ سعید اسماعیل خانیان3 | ||
1موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران | ||
2سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی-موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، بخش تحقیقات بیوتکنولوژی | ||
3بخش بیوتکنولوژی موسسه تحقیقات علوم دامی کشور | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعاتی: ارزیابی میزان همخونی و اثرات ناشی از آن بر روی صفات مهم اقتصادی در پرندگانی که تحت انتخاب قرار دارند از مهمترین اقدامات ارزیابی استراتژیهای اصلاح نژادی به شمار میرود. هدف: مطالعه حاضر با هدف برآورد ضریب همخونی جمعیت، ارزیابی روند تغییرات همخونی و همچنین بررسی اثرات افت ناشی از آن بر روی برخی از صفات اقتصادی مهم بر اساس دادههای شجرهای 12 نسل از جمعیت مرغ بومی ایستگاه اصلاح نژاد خراسان رضوی انجام شد. روش کار: در این پژوهش، ابتدا ضرایب همخونی 38489 پرنده موجود در شجره محاسبه شد و ضرایب همخونی جمعیت بر اساس گروههای مختلف همخونی به صورت تفکیک شده در دستههای مختلف قرار گرفتند. سپس تغییرات میانگین همخونی در طی نسلهای مختلف بررسی و میزان تغییرات در هر سال از طریق برازش رگرسیون خطی همخونی بر نسل محاسبه شد. همچنین در این پژوهش، میزان تابعیت صفات مورد مطالعه از همخونی فردی از طریق مدلهای مختلف برآورد گردید. نتایج: نتایج نشان داد که حدود 57 درصد (21892 پرنده) پرندگان ثبت شده در شجره همخون بودند و میانگین همخونی فردی بیشتر از همخونی مادری بود. میانگین همخونی در کل پرندگان و پرندگان همخون به ترتیب دو و سه درصد برآورد گردید. بیشترین و کمترین میزان همخونی پرندگان شجره به ترتیب برابر با سی و صفر درصد بود. به طور کلی در طی نسلهای مورد مطالعه، متوسط ضریب همخونی فردی و مادری پرندگان در کل جمعیت روند افزایشی را نشان داد، به طوری که با برازش رگرسیون خطی همخونی بر نسل، میزان تغییرات همخونی فردی و مادری در کل جمعیت به ترتیب حدود 03/0± 005/0 و 02/0± 004/0 در نسل برآورد گردیدند. بر اساس نتایج بدست آمده، در بین گروههای همخونی، بیشترین پرندگان همخون (68/47 درصد) را پرندگانی با ضرایب همخونی بین صفر تا پنج درصد تشکیل دادند، که نشاندهنده آن است که همخونی جمعیت نسبتاً پایین است. نتایج برآورد تابعیت صفات از همخونی فردی برای هر صفت با توجه به مناسبترین مدل نشان داد که اثر افت ناشی از همخونی در بیشتر صفات مورد مطالعه کم میباشد. در این مطالعه، بیشترین میزان افت ناشی از همخونی فردی بر صفت وزن بدن در 12 هفتگی نشان داده شد. به ازای هر یک درصد افزایش همخونی، صفات وزن بدن در یک روزگی 04/0 گرم کاهش، هشت هفتگی 51/0 گرم کاهش و 12 هفتگی 17/1 گرم کاهش، سن بلوغ جنسی 19/0 روز افزایش، وزن بلوغ جنسی 05/1 گرم افزایش، تعداد تخممرغ در 84 روز اول تولید 08/0 عدد افزایش، وزن اولین تخممرغ 05/0 گرم کاهش و میانگین وزن تخممرغ در 28-30-32 هفتگی 02/0 گرم کاهش داشتند. نتیجهگیری نهایی: نتایج تحلیل شجره نشان داد که همخونی جمیعت در هر نسل به میزان کمی افزایش یافته است. از آنجایی که در جمعیت تحت انتخاب ایستگاه هیچگونه جریان ژنی وجود ندارد، در صورت عدم کنترل آمیزشها احتمال پیدایش همخونی در جمعیت بالا است. با انجام اقداماتی از قبیل کنترل آمیزشها در جمعیت ایستگاه میتوان از افزایش همخونی جمعیت و همچنین اثرات منفی احتمالی آن بر روی صفات پیشگیری کرد. | ||
کلیدواژهها | ||
تخممرغ؛ صفات رشد؛ مرغ بومی؛ همخونی | ||
مراجع | ||
Akaike H, 1974. A new look at the statistical model identification. IEEE Transactions on Automatic Control 19: 716-723.
Besbes B, Tixier-Boichard M, Hoffmann I and Jain GL, 2007. Future trends for poultry genetic resources. Proceedings of the International Poultry Conference on Poultry in the 21st Century: avian influenza and beyond. pp 1-23. Bangkok, Thailand.
Cassell BG, Amec V and Pearson RE, 2003. Effect of incomplete pedigrees on estimates of inbreeding and inbreeding depression for days to first service and summit milk yield in Holsteins and Jerseys. Journal of Dairy Science 86: 2967-2976.
Cheptou PO and Donohue K, 2011. Environment-dependent inbreeding depression: its ecological and evolutionary significance. New Phytologist 189: 395-407.
Falconer DS and Mackay TFC, 1996. Introduction to Quantitative Genetics, 4th ed. Longman Group Ltd., Essex, UK.
Fischer TM, Van der Werf JHJ, Banks RG and Ball AJ, 2004. Description of lamb growth using random regression on field data. Livestock Production Science 89: 175-185.
Gazal S, Sahbatou M, Perdry H, Letort S, Génin E and Leutenegger AL, 2014. Inbreeding coefficient estimation with dense SNP data: comparison of strategies and application to HapMap III. Human Heredity. 77: 49-62.
Ghorbani S and Emrani H, 2020. Estimation of inbreeding rate and its depression on the economic traits of genetically improved native chickens of north of Iran. Animal Science Journal 33: 109-124.
Ghorbani S and Zakizadeh S, 2021. Estimation of inbreeding effects and its impact on some production and reproduction traits in West Azerbaijan native fowls. Animal Production Research 10: 21-32.
Gomez-Raya L, Rodríguez C, Barragán C and Silió L, 2015. Genomic inbreeding coefficients based on the distribution of the length of runs of homozygosity in a closed line of Iberian pigs. Genetics Selection Evolution 47: 81.
Haunshi S, Ullengala R and Padhi MK, 2019. Improvement of PD-4 (Aseel), an indigenous chicken for growth and production traits. Indian Journal of Animal Sciences 89(4): 419-423.
Jelokhani-Niaraki S and Ghorbani S, 2022. Evaluating the selection of improved Fars native fowl with the inbreeding assessment approach. Journal of Animal Science Research 31(4): 73-88.
Jelokhani-Niaraki S, Ghorbani S and Esmaeilkhanian S, 2021. Estimation of inbreeding depression for economic traits in Isfahan improved native chicken population. Animal Production 23(3): 413-424.
Leroy G, 2014. Inbreeding depression in livestock species: review and meta-analysis. Animal Genetics 45:618-28.
Lewis F, Butler A and Gilbert L, 2011. A unified approach to model selection using the likelihood ratio test. Methods in Ecology and Evolution 2: 155-162.
Magothe T, Okeno T, Muhuyi WB and Kahi A, 2012 (a). Indigenous chicken production in Kenya: I. Current status. World's Poultry Science Journal 68: 119-132.
Magothe T, Okeno T, Muhuyi WB and Kahi A, 2012 (b). Indigenous chicken production in Kenya: II. Prospects for research and development. World’s Poultry Science Journal. 68: 133-44.
Meyer K, 2007. WOMBAT, A tool for mixed model analyses in quantitative genetics by REML. Journal of Zhejiang University Science-B 8: 815-821.
Reed DH, Fox CW, Enders LS and Kristensen TN, 2012. Inbreeding-stress interactions: evolutionary and conservation consequences. Annals of the New York Academy of Sciences 1256:33-48.
Roff DA, 2002. Inbreeding depression: tests of the overdominance and partial dominance hypotheses. Evolution 56: 768-775.
Rusfidra, Tan Marajo SD, Heryandi Y and Oktaveriza B, 2014. Estimation of Inbreeding Rate in Kokok balenggek Chicken (KBC) Population under Ex-Situ Conservation. International Journal of Poultry Science 13: 364-367.
Sargolzaei M, Iwaisaki H and Colleau JJ, 2006. A tool for monitoring genetic diversity. In proceeding of the 8th World Congress Genetics Applied Livestock. ProBelo Horizonte, Brazil.
Schwarz G, 1978. Estimating the dimension of a model. Annals of Statistics 6: 461-464.
Selvaggi M, Dario C, Peretti V, Ciotola F, Carnicella D and Dario M, 2010. Inbreeding depression in Leccese sheep. Small Ruminant Research 89: 42-46.
Spalona A, Ranvig H, Cywa-Benko K, Zanon A, Sabbioni A, Szalay I, Benková J, Baumgartner J and Szwaczkowski T, 2007. Population size in conservation of local chicken breeds in chosen European countries. Archiv fur Geflugelkunde. 71: 49-55.
Szwaczkowski T, Cywa-Benko K and Wezyk S, 2003. A note on inbreeding effect on productive and reproductive traits in laying hens. Animal Science Papers and Reports 21: 121-129.
Szwaczkowski T, Cywa-Benko K, and Wezyk S. 2004. Curvilinear inbreeding effects on some performance traits in laying hens. Journal of Applied Genetics 45: 343-345.
Tongsiri S, Jeyaruban GM, Hermesch S, Van der Werf JH, Li L and Chormai T, 2019. Genetic parameters and inbreeding effects for production traits of Thai native chickens. Asian-Australasian journal of animal sciences 32: 930-938.
Vergeer P, Wagemaker N and Ouborg NJ, 2012. Evidence for an epigenetic role in inbreeding depression. Biology Letters. 8: 798-801.
Vermeulen CJ, Sørensen P, Gagalova KK and Loeschcke V, 2014. Flies who cannot take the heat: genome-wide gene expression analysis of temperature-sensitive lethality in an inbred line of Drosophila melanogaster. Journal of Evolutionary Biology 27: 2152-62.
Vieira FG, Fumagalli M, Albrechtsen A and Nielsen R, 2013. Estimating inbreeding coefficients from NGS data: impact on genotype calling and allele frequency estimation. Genome Research 23:1852-1861.
Xue Q, Li G, Cao Y, Yin J, Zhu Y, Zhang H, Zhou C, Shen H, Dou X, Su Y, Wang K, Zou J and Han W, 2021. Identification of genes involved in inbreeding depression of reproduction in Langshan chickens. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences 34(6): 975-984. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 234 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 203 |