تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,303 |
تعداد مقالات | 16,020 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,489,773 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,217,393 |
ردیابی آلودگی ویروس وای سیب زمینی (Potato virus Y) در حجم وسیع تودههای بذری سیب زمینی با استفاده تلفیقی از روشهای مولکولی و کشت تک جوانه | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
دوره 11، شماره 1، فروردین 1401، صفحه 121-126 اصل مقاله (956.56 K) | ||
نوع مقاله: مقاله کوتاه | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/arpp.2021.13587 | ||
نویسندگان | ||
کبری مسلم خانی* 1؛ فاطمه خلقتی بناء2؛ محمد محمدی1؛ جهانبخش حسین نژادیان1؛ فرشید حسنی1؛ شمس اله نیکجه فراهانی1؛ کمال الدین عباسی1 | ||
1مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. | ||
2آزمایشگاه گیاهپزشکی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران. | ||
چکیده | ||
چکیده سالانه بیش از 300 محموله بذری سیب زمینی در سیستم رسمی کنترل و گواهی بذر کشور با هدف کاهش عوامل بیماریزای سیستمیک و تجمعی، از نظر آلودگی به ویروس های مهم سیب زمینی مورد آزمون قرار می گیرند. در این فرآیند درستی، حساسیت، اختصاصیت و سرعت روش تشخیصی برای صدور گواهی به موقع و صحیح از اهمیت بسیاری برخوردار است. در پژوهش حاضر کارایی استفاده تلفیقی از روش کشت تک جوانه و روشهای مولکولی مبتنی بر RT-PCR برای ردیابی آلودگی ویروس وای سیب زمینی (PVY) در آزمون تعداد زیاد نمونه های بذری مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این تحقیق نشان داد حساسیت، دقت و حتی سرعت ارزیابی توده های بذری با روش های مبتنی بر RT-PCR در مقایسه با روش سرولوژیکی ELISA افزایش می یابد. بهره گیری از روش RT-PCR در ردیابی ویروس PVY ، دارای دقت تشخیصی یک نمونه آلوده در نمونه ترکیبی حاصل از 50 بوته بوده در حالیکه توانایی روش ELISA به میزان یک دهم این قابلیت بود و این روش قادر به ردیابی یک نمونه آلوده در نمونه ترکیبی حاصل از پنج نمونه انفرادی بود. همچنین به دلیل دقت بسیار بیشتر آزمون های مبتنی بر RT-PCR صدور گواهی نادرست برای طبقه بذری مشاهده نشد، حال آن که بر اساس نتایج ELISA حدود شش درصد از توده های بذری مورد آزمون به جای طبقه گواهی شده به دلیل عدم توان ردیابی غلظت کم ویروس به اشتباه در طبقه مادری گواهی شدند. بر اساس استانداردهای ملی حداکثر آلودگی مجاز به PVY در پایین ترین طبقه بذری چهار درصد است که همین موضوع قابلیت اجرایی شدن این سیستم را با هزینه های قابل قبول (حداکثر با ارزیابی پنج زیر نمونه) فراهم میآورد. | ||
کلیدواژهها | ||
کلمات کلیدی: توده بذری؛ سیب زمینی؛ ردیابی؛ گواهی و ویروس | ||
مراجع | ||
References
Aurori A, Badarau CL, Rakosy-Tican E, 2016. Challenges in the detection and identification of Potato virus Y, an important pathogen of potato. Studia Universitatis Babes-Bolyai, Biologia 61(2). Baldauf PM, Gray SM, Perry KL, 2006. Biological and serological properties of Potato virus Y isolates in northeastern United States potato. Plant Disease 90: 559–566. Drygin YF, Blintsov AN, Grigorenko VG, Andreeva IP, Osipov AP, et al., 2012. Highly sensitive field test lateral flow immunodiagnostics of PVX infection. Applied Microbiology and Biotechnology 93: 179–189. Du Z, Chen J, Hiruki C, 2006. Optimization and application of a multiplex RT-PCR system for simultaneous detection of five potato viruses using 18S rRNA as an internal control. Plant Disease 90: 185–189. Dupuis B, 2017. The movement of Potato virus Y (PVY) in the vascular system of potato plants. European Journal of Plant Pathology 147: 365–373. Eigenbrode SD, Ding H, Shiel P, Berger PH, 2002. Volatiles from potato plants infected with potato leafroll virus attract and arrest the virus vector, Myzus persicae (Homoptera: Aphididae). Proceedings of the Royal Society of London. Series B. Biological Sciences 269: 455–460. Hühnlein A, Drechsler N, Steinbach P, Thieme T, Schubert J, 2013. Comparison of three methods for the detection of Potato virus Y in seed potato certification. Journal of Plant Diseases and Protection 120: 57–69. Jeong JJ, Ju HJ, Noh J, 2014. A review of detection methods for the plant viruses. Research in Plant Disease 20: 173–181. Kogovšek P, Gow L, Pompe-Novak M, Gruden K, Foster GD, et al., 2008. Single-step RT real-time PCR for sensitive detection and discrimination of Potato virus Y isolates. Journal of Virological methods 149: 1-11. Moslemkhani C, Hasani F, Khaledi N, 2018. Development of seed potato certification system in Iran and Potato virus Y as the most important factor in disruption of certification system. Iranian Journal of Seed Science and Research 5:111–119 (in Persian with English abstract). Peiman M, Xie C, 2006. Sensitive detection of potato viruses, PVX, PLRV and PVS, by RT-PCR in potato leaf and tuber. Australasian Plant Disease Notes 1: 41–46. Pfaffi MW, 2001. A new mathematical model for relative quantification in real time RT- PCR. Nucleic Acids Researches 29: 2002–2007 Peterschmitt M, Quiot JB, Reynaud B, Baudin P, 1992. Detection of maize streak virus antigens over time in different parts of maize plants of a sensitive and a so‐called tolerant cultivar by ELISA. Annals of Applied Biology 121 (3): 641–653. Russo P, Miller L, Singh RP, Slack SA, 1999. Comparison of PLRV and PVY detection in potato seed samples tested by Florida winter field inspection and RT-PCR. American Journal of Potato Research 76: 313–316. Schumpp O, Bréchon A, Brodard J, Dupuis B, Farinelli L, et al., 2021. Large-Scale RT-qPCR Diagnostics for Seed Potato Certification. Potato Research 1–17. Singh M, Singh RP, Fageria MS, Nie X, Coffin R, et al., 2013. Optimization of a Real-Time RT-PCR assay and its comparison with ELISA, conventional RT-PCR and the grow-out test for large scale diagnosis of Potato virus Y in dormant potato tubers. American Journal of Potato Research 90: 43–50. Webster CG, Wylie SJ, Jones MG, 2004. Diagnosis of plant viral pathogens. Current Science 25: 1604-1607. Yang JG, Wang FL, Chen DX, Shen LL, Qian YM, et al., 2012. Development of a one-step immunocapture real-time RT-PCR assay for detection of Tobacco Mosaic Virus in Soil. Sensors 12: 16685–16694. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 985 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 537 |