تعداد نشریات | 44 |
تعداد شمارهها | 1,303 |
تعداد مقالات | 16,022 |
تعداد مشاهده مقاله | 52,493,401 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 15,219,722 |
استفاده از روش های سری زمانی جهت پیش بینی بیان ژن های دفاعی گندم تلقیح شده با Zymoseptoria tritici و اسیدسالیسیلیک | ||
پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
مقاله 6، دوره 8، شماره 4، اسفند 1398، صفحه 81-101 اصل مقاله (1.01 M) | ||
نویسندگان | ||
جلال غلام نژاد* 1؛ فروغ سنجریان2؛ مسعود فهرستی3 | ||
1استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران. | ||
2استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران. | ||
3استادیاردانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران. | ||
چکیده | ||
چکیده اندازهگیری میزان بیان ژنهای دفاعی گیاهی روشی پرکاربرد و مفید برای بررسی مکانیسم مقاومت در گیاهان است، اما این روش در عین حال هزینه بر و زمانبر نیز میباشد. به منظور بررسی تأثیر اسیدسالیسیلیک بر تغییرات بیان بعضی از ژنهای دفاعی درگیر در مقاومت (NADPH اکسیداز، اگزالات اکسیداز، پروتئین Stress responsive، گلوتاتیون S ترانسفراز و سوپراکسید دیسموتاز) گندمهای تلقیح شده با بیمارگر Z. triticiبه روش نوردرنبلات معکوس بررسی شد. بر اساس اطلاعات به دست آمده از نوردرن بلات معکوس جهت پیشبینی بیان ژنهای درگیر در مقاومت از روشهای میانگین متحرک ساده، میانگین متحرک وزنی و هموار سازی نمایی استفاده شد. در 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر در همۀ ژنهای مورد بررسی و در هر دو تیمار میزان بیان به بیشترین مقدار خود رسید و علیرغم تفاوت در هر ژن روند کلی افزایشی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از روش هموارسازی نمایی، با توجه به محاسبۀ و مقایسۀ شاخصهای قدرت پیشبینی، دارای دقت بالاتری نسبت به دو روش دیگر میباشد. میزان بیان، در مورد سه ژن NADPH اکسیداز، گلوتاتیون S ترانسفراز و اگزالات اکسیداز روند مشابه داشتند، به عبارتی تا 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر، اسیدسالیسیلیک باعث افزایش شد و سپس میزان بیان روند کاهشی در پیش گرفت. بررسی بیان ژن روش بسیار حساسی است، و باید تحت شرایط کنترل شده باشد، و فقط تیمار مورد نظر محقق، تأثیرگذار بر روی بیان ژن در گیاه باشد، در این شرایط، پیشنهاد میشود اطلاعات بیان ژنها در طی دورههایی ابتدایی اندازهگیری شود، سپس با استفاده از این اطلاعات و روشهای پیشبینی میزان بیان، برای زمانهای بعدی مورد پیشبینی قرار گیرد. | ||
کلیدواژهها | ||
واژههای کلیدی: بیان ژن؛ نوردرن بلات معکوس؛ پیشبینی؛ گندم؛ Zymoseptoria tritici | ||
مراجع | ||
Adhikari TB, Balaji B, Breeden J and Goodwin SB. 2007. Resistance of wheat to Mycosphaerella graminicola involve early and late peaks of gene expression. Physiological and Molecular Plant Pathology, 71: 55-68. Anders, S. and Huber, W. 2010. Differential expression analysis for sequence count data. Genome Biology, 11:R106. Arraiano, L. and Brown, J. 2007. Genetic analysis of Septoria tritici blotch to improve resistance in European wheat breeding programmes. Wheat Production in Stressed Environments: 12: 109-112. Cao SF, Hu ZC, Zheng YH and Lu BH. 2010. Synergistic effect of heat treatment and salicylic acid on alleviating internal browning in cold-stored peach fruit. Postharvest Biology and Technology, 58(2): 93-97. Chartrain L., Berry ST and Brown JKM. 2004: Resistance of wheat line Kavkaz-K4500 L.6.A.4 to septoria tritici blotch controlled by isolate-specific resistance genes. Phytopathology, 95: 664–671. Christensen AB, Cho BH, Næsby M, Gregersen PL, Brandt J, Madriz-Ordeñana K. 2002. The molecular characterization of two barley proteins establishes the novel PR-17 family of pathogenesis-related proteins. Molecular Plant Pathology, 3(3): 135-144. Dunwell JM, Khuri S, Gane PJ. 2000. Microbial relatives of the seed storage proteins of higher plants: conservation of structure and diversification of function duringevolution of the cupin superfamily. Microbiol Molecul Biol Reviews; 64:153-79. Esllahi M. R., Safaie, N. and Saidi, A. 2013. Study of resistant gene expression of wheat against to Mycosphaerella graminicola by cDNA-AFLP. PhD thesis, Tarbiat Modares university (in Persian with English abstract). Eyal Z, Scharen A, Prescott J and Van Ginkel M. 1987. The Septoria diseases of wheat: concepts and methods of disease management. International Maize and Wheat Improvment Centre (CIMMYT), Mexico, DF. Eyal, Z. 1999. Breeding for resistance to Septoria and Stagonospora diseases of wheat. Septoria on Cereals: A Study of Pathosystems. JA Lucas, P. Bowyer, and AM Anderson, eds .CAB International, Wallingford, UK: 115-130. Gelper S, Fried R, Croux CH. 2010. Robust Forecasting with Exponential and Holt Winters Smoothing, Journal of forecasting, Vol. 29, No. 3, 285–300. Gholamnejad J, Etebarian HR, Roustaee, A. Sahebani N. 2009a. Biological control of apple blue mold by isolates of Saccharomyces cerevisiae. Journal of Plant Protection research, 49: 270-275. Gholamnejad J, Etebarian HR, Sahebani NA, and Roustaee A. 2009b. Characterization of biocontrol activity of two yeast strains from Iran against blue mould of apple in order to reduce the environmental pollution. Journal of International Environmental Application and Science, 4(1), 28-36 Gholamnejad J, Etebarian HR and Sahebani N. 2010. Biological control of apple blue mold with Candida membranifaciens and Rhodotorula mucilaginosa. African Journal of Food Science 4: 001-007. Gholamnezhad J. 2016. Transcriptomics and useful techniques of defense gene expression evolution of plant. Applied biology, 6(4): 21-42. Gholamnezhad J. 2017. Effect of plant extracts against apple gray mold caused by Botrytis cinerea. Applied Microbiology In Food Industries, 3(1): 53-66. Gholamnezhad J. 2018. Effect of plant extracts on activity of some defense enzymes of apple fruit in interaction with Botrytis cinerea. Journal of Integrative Agriculture, 17(0): 1-10. Gholamnezhad J, Sanjarian F, Mohammadi goltapeh E, Safaei N & Razavi Kh. 2016b. Effect of salicylic acid on enzyme activity in wheat in immediate early time after infection with Mycosphaerella graminicola. Scientia agriculturae bohemica, 47(1): 1-8. Gholamnezhad J, Sanjarian F, Mohammadi goltapeh E, Safaei N and Razavi Kh. 2016c. Study of defense genes expression profile pattern of wheat in response to infection by Mycosphaerella graminicola, Iranian Journal of Plant Biology, 8(30): 43-55. Goodwin SB. 2007. Back to basics and beyond: increasing the level of resistance to Septoria tritici blotch in wheat. Australasian Plant Pathology 36: 532-538. Kawano, T., T. Furuichi and L.Shoshi Muto. 2004. Controlled Salicylicacid levels and corresponding signaling mechanisms in plants. Plant Biotechnology, 21:319 – 335. Kia S and Torabi M. 2008. Effects of infection with septoria leaf blotch (Septoria tritici) at different growth stages on yield and yield components of wheat cultivars in Gorgan. Seed and Plant, 24: 237-250 (in Persian). Makridakis S, Wheel wright SC, Hyndaman RJ. 1998. Forecasting Methods and Applications, New York, Wiley. Miao Y, Zentgraf U. 2007. The Antagonist Function of Arabidopsis WRKY53 and ESR/ESP in Leaf Senescence Is Modulated by the Jasmonic and Salicylic Acid Equilibrium. The Plant Cell Online, 19: 819-830. Ostertagova E, Ostertag O. 2011. The Simple Exponential Smoothing Model, Proceedings of the 4th International Conference on Modeling of Mechanical and Mechatronic Systems, Technical University of Koˇsice, Slovak Republic, 380–384. Quaedvlieg W, Kema G H J, Groenewald JZ, Verkley GJM, Seifbarghi S, Razavi M, Gohari AM, Mehrabi R. 2011. "Zymoseptoria gen. Nov.: A new genus to accommodate Septoria-like species occurring on graminicolous hosts". Persoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi, 26: 57–69. Rabbani MA, Maruyama K, Abe H, Khan M A, Katsura K, Ito Y, Yoshiwara K, Seki M, Shinozaki K and Yamaguchi-Shinozaki K. 2003. Monitoring expression profiles of rice genes under cold, drought, and high-salinity stresses and abscisic acid application using cDNA microarray and RNA gel-blot analyses. Plant Physiology, 133: 1755-1767. Rezvani Moghaddam, P and A. Koocheki. 2001. Research history on salt affected lands of Iran: Present and future prospects – Halophytic ecosystem – International symposium on prospects of saline agriculture in the GCC Countries. Dubai, UAE. Schröder P. 2000. Metabolism of Organic Xenobiotics in Plants: Conjugating Enzymes and Metabolic Endpoints. In: Intercost Workshop on Bioremediation, Italy. Skinner E, Waterson M. 2001. Improvement of a standard MIRA method for urinary oxalate by elimination of reagent carry –over. Annal Clin Biochemistry, 38: 54-56. Torres MA, Jones JDG and Dangl JL. 2005. Pathogen-induced, NADPH oxidase-derived reactive oxygen intermediates suppress spread of cell death in Arabidopsis thaliana. Nature genetics, 37: 1130-1134. Van Ginkel, M and Rajaram, S. 1999. Breeding for resistance to the Septoria/Stagonospora blights of wheat. In: M. van Ginkel, A. McNab, and J. Krupinsky, ed. Septoria and Stagnospora Diseases of Cereals: A Compilation of Global Research. CIMMYT, Mexico, DF, pp. 117-126. Yang F, Li W and Jorgensen H J L. 2013. Transcriptional reprogramming of wheat and the hemibiotrophic pathogen Septoria tritici during two phases of the compatible interaction. PLoS One, e81606. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 707 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 542 |