آمار
| تعداد نشریات | 45 |
| تعداد شماره‌ها | 1,370 |
| تعداد مقالات | 16,844 |
| تعداد مشاهده مقاله | 54,232,957 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,944,073 |
شناسایی بیوانفورماتیک دو ویروس زعفران در ایران با استفاده از آنالیز داده‌های توالی‌یابی با راندمان بالا | ||
| پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی | ||
| دوره 13، شماره 3، مهر 1403، صفحه 259-267 اصل مقاله (620.2 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/arpp.2024.18159 | ||
| نویسندگان | ||
| وحید رومی* 1؛ مینا راستگو2 | ||
| 1گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران. | ||
| 2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران. | ||
| چکیده | ||
| زعفران (Crocus sativus) یک گیاه چند ساله با ارزش است که به طور وسیعی در ایران بعنوان یک گیاه ادویه ای و دارویی کشت می شود. بیمارگرهای متعددی از جمله ویروس ها می توانند زعفران را آلوده کرده و کیفیت و کمیت محصول را کاهش دهند. بدلیل دردسترس نبودن مواد شیمیایی ضد ویروسی بصورت تجاری، تشخیص دقیق و قابل اعتماد یک جنبه حیاتی در مدیریت بیماری های ویروسی است. امروزه توالی یابی با بازده بالا (high throughput sequencing) به تکنولوژی رایج تشخیص ویروس های شناخته شده و نیز ویروس های جدید در گیاهان تبدیل شده است. در این مطالعه با استفاده از آنالیز توالی یابی با بازده بالا، ویروس پنهان زعفران (SaLV) و ویروس تی هسته داران (PrVT) درداده های ترانسکریپتوم حاصل از خامه زعفران شناسایی شد و ترادف تقریبا کامل این ویروس ها بدست آمد. ترادف نوکلئوتیدی SaLV 98.3 درصد یکسانی ترادف با تنها جدایه موجود در ژن بانک داشت. کمترین و بیشترین میزان یکسانی ترادف نوکلئوتیدی جدایه زعفران PrVT با تپوویروس های موجود در ژنبانک بین 42.9 درصد (ویروس تی سیب زمینی جدایه پرو) و 76.9 درصد (جدایه GR168 ویروس تی زیتون(OlVT)) بود. در درخت تبارزایی، جدایه زعفران PrVT به همراه دو جدایه OlVT از یونان و یک جدایه PrVT در یک گروه قرار گرفتند. این تحقیق، اولین گزارش از وقوع PrVT بر روی زعفران در دنیا می باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| ویروس؛ زعفران؛ HTS؛ ایران؛ PrVT | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 742 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 489 |
||